FNA File (มันคืออะไรและจะเปิดได้อย่างไร)

สารบัญ:

FNA File (มันคืออะไรและจะเปิดได้อย่างไร)
FNA File (มันคืออะไรและจะเปิดได้อย่างไร)
Anonim

ต้องรู้

  • ไฟล์ FNA เป็นไฟล์ DNA รูปแบบ FASTA และไฟล์การจัดลำดับโปรตีน
  • เปิดด้วยใจกว้าง
  • แปลงเป็น FASTA และรูปแบบที่คล้ายกันด้วยโปรแกรมเดียวกันนั้น

บทความนี้อธิบายว่าไฟล์ FNA คืออะไร วิธีเปิดไฟล์ และวิธีบันทึกไฟล์เป็นรูปแบบอื่น เช่น FASTA, GB, VCF, รูปภาพ ฯลฯ

ไฟล์ FNA คืออะไร

ไฟล์ที่มีนามสกุลไฟล์ FNA คือไฟล์จัดแนว DNA ของฟอร์แมต FASTA และไฟล์การจัดลำดับโปรตีนที่เก็บข้อมูล DNA ที่ซอฟต์แวร์อณูชีววิทยาสามารถใช้ได้

ไฟล์ FNA โดยเฉพาะ อาจใช้เพื่อเก็บข้อมูลกรดนิวคลีอิก ในขณะที่รูปแบบ FASTA อื่นๆ มีข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับ DNA อื่นๆ เช่น ไฟล์ที่มี FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET หรือนามสกุลไฟล์ AA

รูปแบบ FASTA แบบข้อความเหล่านี้เดิมสร้างขึ้นจากแพ็คเกจซอฟต์แวร์ที่มีชื่อเดียวกัน แต่ตอนนี้ถูกใช้เป็นมาตรฐานในแอปพลิเคชันการจัดตำแหน่ง DNA และโปรตีนตามลำดับ

Image
Image

FNA ยังหมายถึงคำศัพท์ทางเทคโนโลยีบางอย่างที่ไม่เกี่ยวข้องกับรูปแบบไฟล์นี้ เช่น การยอมรับเครือข่ายขั้นสุดท้าย ชื่อไฟล์/สิ่งอำนวยความสะดวกในการเสริมแอตทริบิวต์ สถาปัตยกรรมเครือข่ายฟูจิตสึ และโฆษณาเพื่อนบ้านที่รวดเร็ว

วิธีการเปิดไฟล์ FNA

เปิดใน Windows, macOS และ Linux ด้วย Geneious (ฟรี 14 วัน) ในการดำเนินการนี้ ให้ไปที่เมนู File > นำเข้า และเลือกนำเข้าไฟล์ผ่าน จากไฟล์รายการเมนู

คุณอาจเปิดได้ด้วย BLAST Ring Image Generator (BRIG)

ลองใช้ Notepad++ หรือโปรแกรมแก้ไขข้อความอื่นหากแนวคิดเหล่านั้นไม่ได้ผล ไฟล์อาจเป็นแบบข้อความและอ่านง่าย หรือคุณอาจพบว่าไม่เกี่ยวข้องกับรูปแบบ FASTA ซึ่งการเปิดไฟล์เป็นเอกสารข้อความอาจแสดงข้อความที่ระบุถึงสิ่งที่ใช้สร้างไฟล์ หรือไฟล์อยู่ในรูปแบบใด

วิธีแปลงไฟล์ FNA

เราไม่สามารถตรวจสอบได้เนื่องจากเรายังไม่ได้ลอง แต่คุณควรจะสามารถใช้ Geneious เพื่อแปลงไฟล์เป็นรูปแบบอื่นๆ ได้มากมาย เช่น FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV และ VCF สามารถทำได้ผ่าน File > Export menu. ของโปรแกรม

โปรแกรมเดียวกันนั้นควรจะสามารถบันทึกไฟล์เป็น PNG, JPG, EPS หรือ PDF ผ่าน File > บันทึกเป็นไฟล์รูปภาพ.

แม้ว่าโดยปกติคุณจะไม่สามารถเปลี่ยนชื่อนามสกุลของไฟล์เป็นอย่างอื่นและคาดว่าจะทำงานในลักษณะเดียวกันได้ แต่คุณสามารถเปลี่ยนชื่อไฟล์. FNA เป็นไฟล์. FA ได้หากซอฟต์แวร์จัดลำดับ DNA เฉพาะของคุณรับรู้ได้เท่านั้น รูปแบบ FA

แทนที่จะเปลี่ยนชื่อนามสกุลไฟล์ คุณจะต้องใช้ตัวแปลงไฟล์ฟรีเพื่อแปลงไฟล์ประเภทอื่นๆ ในกรณีของไฟล์ FNA และ FA บางโปรแกรมจะเปิดเฉพาะไฟล์ที่มีนามสกุลไฟล์ FA เท่านั้น ซึ่งในกรณีนี้การเปลี่ยนชื่อก็ใช้ได้ดี

ยังเปิดไม่ได้หรือ

หากใช้โปรแกรมจากด้านบนแล้ว ยังไม่สามารถเปิดไฟล์ได้ คุณอาจพบว่านามสกุลไฟล์นั้นไม่ได้อ่าน. FNA จริงๆ แต่มีบางอย่างที่ดูคล้ายกันแทน

ตัวอย่างเช่น ไฟล์ FNG (Font Navigator Group) ดูเหมือนจะแย่มากๆ อย่างที่พวกเขาพูดว่า ". FNA" แต่ถ้าคุณมองดีๆ มีเพียงสองตัวอักษรแรกเท่านั้นที่เหมือนกัน เนื่องจากนามสกุลไฟล์ต่างกัน จึงเป็นเครื่องบ่งชี้ว่ารูปแบบไฟล์ต่างกันและมักจะใช้ไม่ได้กับโปรแกรมเดียวกัน

อาจกล่าวได้เช่นเดียวกันสำหรับนามสกุลไฟล์อื่นๆ เช่น FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) และ FND (Windows Saved Search)

แนวคิดตรงนี้คือทำให้แน่ใจว่านามสกุลไฟล์เป็น. FNA หากเป็นเช่นนั้น ให้ลองใช้โปรแกรมจากด้านบนอีกครั้งเพื่อเปิดหรือแปลง หากคุณมีไฟล์ประเภทอื่น ค้นคว้าส่วนขยายของไฟล์เพื่อค้นหาว่าต้องใช้แอปพลิเคชันใดในการเปิดหรือแปลงไฟล์

คำถามที่พบบ่อย

    คุณเปิดไฟล์ FNA ใน Python ได้อย่างไร

    ขั้นแรก ให้แปลงไฟล์ FNA เป็นรูปแบบ FASTA โดยใช้แอปพลิเคชันของบริษัทอื่น เช่น Geneious จากนั้น คุณสามารถดาวน์โหลด Biopython ซึ่งเป็นชุดเครื่องมือที่ใช้ได้ฟรีสำหรับการคำนวณทางชีววิทยาสำหรับการทำงานในชีวสารสนเทศ สุดท้าย ให้อ้างอิงกับ Biopython Tutorial and Cookbook สำหรับคำแนะนำในการใช้งานไฟล์ FASTA

    ฉันจะค้นหาหมายเลขผู้สร้าง FNA ในไฟล์ดิบของบรรพบุรุษได้อย่างไร

    คุณสามารถดาวน์โหลดข้อมูล DNA ส่วนใหญ่ได้จาก Ancestry.com ในรูปแบบ.txt อย่างไรก็ตาม เฉพาะลูกค้าที่มีการวิเคราะห์ DNA ด้วยการจัดลำดับยุคหน้า (NGS) เท่านั้นที่มีตัวเลือกในการดาวน์โหลดไฟล์ VCFในการดาวน์โหลดไฟล์ VCF คุณต้องเป็นเจ้าของ DNA ได้รับการทดสอบ DNA โดยใช้เทคโนโลยี NGS และมีพื้นที่ว่างในอุปกรณ์ของคุณอย่างน้อย 350 MB

แนะนำ: